חברת מקורות עומדת בחזית הידע ההנדסי, בין היתר בזכות ניסויים, סקרים ומחקרים הנדסיים בתחומי הבטחת איכות המים והטיפול בהם, הנערכים בחסותה באופן שוטף.

הסקרים והמחקרים נערכים על ידי עובדי החברה או בשיתוף גורמי חוץ מדעיים כמו: אוניברסיטאות, הטכניון, מוסדות מחקר ומדענים המתמחים בתחומים ספציפיים. היוזמות לביצוע מגיעות מעובדי החברה או מגורמים חיצוניים, הן נבחנות על ידי ועדות מקצועיות ומוכרעות בוועדה העליונה לסקרים ומחקרים הנדסיים.

בעת שקילת כדאיות המחקרים, הוועדות המקצועיות בוחנות את התועלת הצפויה מהמחקר לשיפור איכות המים, את פוטנציאל הידע החדשני ואת יעילות שיטות הטיפול והבדיקה המוצעות בו. לכל מחקר, ניסוי או סקר, ממנה מקורות רפרנט מטעמה האחראי לנהל ולעקוב אחר הביצוע (בכלל זה: קביעת תכנית עבודה, קצב ואיכות הביצוע ועמידה במסגרת התקציבית).

בכל שנה בוחנת הוועדה המקצועית של מקורות את ההצעות למחקרים חדשים ואת תוצאות המחקרים מן השנה שחלפה וממליצה לוועדה העליונה אילו מחקרים לתקצב. במהלך העשור האחרון התבצעו במסגרת מקורות מעל 450 מחקרים וסקרים שונים.