מתקן הסינון הוקם בשנת 1998  כפרוייקט BOT על ידי שח"מ חברת בת של חברת מקורות , ומתופעל בידי חברת "מקורות". זהו מפעל המים היחיד שמספק מים לעיר ולכן הוא פעיל במשך כל ימות השנה. במתקן שלוש משאבות (אחת רזרבית) השואבת את מי הכנרת 200 מטר מהחוף. המים זוכים לניקוי ראשוני במסננים. בסך הכל מסוננים 1,400 מ"ק מים בשעה. לאחר מכן עוברים המים סינון במסננים משניים (סינון עד גודל של 50 מיקרון), עוברים טיפול קדם שבמהלכו מוסיפים להם חומרים לחיטוי וליצירת התלכדות ושקיעה של גרגירי לכלוך זעירים. משם הם מועברים בצינור תחת כביש 90 אל מפעל הסינון עצמו. במתקן עוברים המים במסנני חול ומועברים אל בריכה שהקיבולת שלה 2,000 מ"ק. מהבריכה עוברים המים בכוח הכבידה אל בריכה נוספת, השייכת לעיריית טבריה. חמש משאבות מעלות את המים אל העיר.