תעלת הירדן הינה תעלה פתוחה המוליכה את מי המוביל הארצי בואכה מאגר צלמון למרחק של כ- 17,000 מטר בתוואי הררי כאשר בדרך זו עוברים המים 2 וואדיות: ואדי עמוד בעומק 150 מ' וואדי צלמון בעומק 70 מטר. תעלה זו חצובה כמעט כולה בסלע, בשיפולי ההר.
המים זורמים בתעלת הירדן מכוח הכבידה (הגרוויטציה) בעומק של 2.70 מ', בזרימה מלאה. עומקה של התעלה 3.15 מ' ורוחבה נע בין 2.5 מ' בקרקעית ל- 12 מ' במפלס העליון.
כדי למנוע זרימת סחף אל התעלה, אשר מרבית מימיה מיועדים לשתייה, נחצבה תעלת ניקוז בצד המדרון, לתוכה מתנקזים מי הנגר.
בקטעים מסוימים, העוברים בפרשות מים, ניבנו מעל לתעלת הירדן, גשרי תעלה, המעבירים את מי הנגר לעבר הוואדי הטבעי, אשר דרכו נשפכים וזורמים המים אל הים.  בשטח שבין תעלת הירדן לתעלת הניקוז נזרעו צמחי-בר האמורים למנוע סחף. כמו כן, ניבנו מדרגות אבן קטנות באותם קטעים מהשטח המיועדים במיוחד לסחף. משני צידי התעלה הוקמה גדר.
מתעלת הירדן נשפכים המים אל מאגר תפעולי – מאגר צלמון.