חברת מקורות עברה בשנת 2004 שינוי מבני שיצר עבורה אתגרים חדשים בתחום פיתוח משק המים. בין היתר אוחדו כל יחידות הביצוע בחברה לכדי חברת בת אחת - "שח"מ- מקורות ביצוע", וכן התחייבה החברה להוציא 33% מעבודות הפיתוח לביצוע על ידי קבלנים חיצוניים.
מקורות מניחה תשתיות תת-קרקעיות שמיועדות לעשרות שנים, ומקימה מתקנים ייחודיים בשוק הישראלי מבחינת היקפם הכספי והסטנדרטים הטכניים הנדרשים להקמתם ותפעולם.
מאפיינים אלו מבדילים את עבודות התשתית במקורות מפרויקטים אחרים שמתבצעים במשק.
מטבע הדברים מחייבת הקמתן של תשתיות אלו איכות ויכולות ביצוע גבוהות מאוד. בהקשר זה העמיד הגידול בהיקף הביצוע על-ידי קבלנים חיצוניים אתגרים חדשים בפני החברה, והגביר את הצורך בקיומם של תהליכי בקרה והבטחת איכות (QA/QC) על מנת להבטיח איכות ביצוע גבוהה על פי הסטנדרטים הגבוהים של מקורות.
הדרך העיקרית שבה מתמודדת החברה עם אתגרים אלו היא באמצעות יחידת הפיקוח הארצי. היחידה פועלת לאבטחת איכות הקמתם של מתקני "מקורות" ווידוא עמידתם בסטנדרטים הגבוהים הקיימים בחברה, תוך עמידה בלוחות הזמנים של הפרויקטים ובמסגרת התקציב שלהם. לשם כך מבצעת היחידה פיקוח ובקרה על למעלה מ - 100 אתרי עבודה בכל שבוע.
ביחידה פועלים כיום יותר מ - 45 מפקחים. כל אחד מהם הוא מהנדס שעבר הסמכה לפקח על הקמת מתקני מים בחברת מקורות וקיבל חניכה ביחידה בתחילת עבודתו בה. מטרתם העיקרית של המפקחים הינה לוודא שהמתקנים שמוקמים הינם מתקנים איכותיים ובעלי קיים ארוך. המפקחים מבקרים בכל האתרים שבהם מתבצעות עבודות ובחלק מהפרויקטים גם עורכים פיקוח צמוד. מוטלת עליהם גם האחריות לוודא את קיום תנאי הבטיחות הנאותים באתרי העבודה.
יחידת הפיקוח מעורבת בפרויקט משלב ההכנה המוקדמת ועד לאחר סיום העבודה (בשלבי התחקיר ואישורי החשבונות הסופיים). המפקחים שותפים גם לביצוע התחקירים שמתקיימים בסיום הפרויקטים. הם נעזרים בעבודתם בתקנים ישראלים ובינלאומיים ובקבצי תקנים ייחודיים וגבוהים למתקני מים שפותחו במקורות במשך שנים רבות, וכן במעבדות איכותיות ומוסמכות, במערכות מחשוב מודרניות , במתודולוגיה של דווח ובניהול סיכונים.
על מנת לשמור על הרמה המקצועית הגבוהה של המפקחים, ממשיכה החברה להכשיר אותם באופן מתמיד בתחומי הפעילות שונים הנוגעים לעבודתם: ריתוך ושיטות בקרה, מתקני אגירת מים, תחנות שאיבה וקווי מים בכל הקטרים עד "108 אינצ' (2.65 מ'), הגנה קתודית, בטחון מים, איכות מים ובטיחות.
לאחרונה החלה מקורות בדירוג איכות הביצוע של הקבלנים במטרה להפיק לקחים שיעלו את רמת הביצוע בפרויקטים עתידיים. הקריטריונים העיקריים לפיהם מתבצע דירוג זה הם: איכות התוצרים, צורת ההתארגנות, קבלת הוראות המפקח, רמת הבטיחות בשטח, אופן הגשת החשבונות, עמידה בלו"ז וכמות השינויים שנדרשה במהלך הביצוע.
האתגרים החדשים והגדולים מציבים את היחידה בחזית הטכנולוגיה בתחום בקרת האיכות וקבלת תוצרים ומתקנים בעלי קיים ארוך יותר המאפשרים התייעלות בעלויות התפעול והאחזקה ומהווים דוגמא לחיקוי במשקי מים אחרים בארץ ובעולם.