חברת מקורות מתפעלת כ - 3,000 מתקני מים בפריסה ארצית המהווים יחדיו את מערכת המים הארצית. מתקנים אלה הם התשתית לכל תחומי הפעילות של החברה: אספקת מים, אבטחת איכות מים, טיפול בשפכים, התפלה ותחומי פעילות נוספים.
מערך מתקני המים של מקורות מונה כמות עצומה של ציוד ואלפי מתקנים שונים: 659 תחנות שאיבה, 1,042 קידוחים, 1,822 יחידות שאיבה, 10,500 ק"מ קווי מים, 637 בריכות בטון ופלדה בנפח 500 מ"ק ומעלה, 91 מאגרים, 31 מתקני התפלה, 6 מעבדות ו - 8 מרכזי תפעול ובקרה ממוחשבים. מערכות אלה מבטיחות אספקת מים אמינה וסדירה באיכות ראויה.
המספר הרב של המפעלים ומתקני המים אותם מקימה, מתפעלת ומתחזקת חברת מקורות מצריך השקעת משאבים רבים בניהול שוטף, תפעול, בקרה ופיקוח ואחזקה. פעילויות אלו שלהן היקף רחב ביותר, הינן חיוניות לשמירה על ביטחונם ואיכותם הגבוהה של מי השתייה המסופקים לצרכנים במדינת ישראל.