מאז היווסדה לקחה חלק מקורות בייזום ובהוצאה לפועל של קרוב ל – 2,600 קידוחים למטרות הפקת מים, ניטורמי תהום ומחקר. כיום מתפעלת חברת מקורות קרוב ל – 1,050 קידוחים לצרכי אספקת מים בכל חלקי הארץ, שמשמשים לאספקה של כ - 65% מסך כל המים המסופקים על ידי חברת מקורות.
קידוחי מים המוקמים ומתופעלים על ידי חברת מקורות מתבצעים בטכנולוגיות מתקדמות תוך יישום שיטות והליכי קדיחה הנהוגים בקידוחי נפט. עם ההתפתחות הטכנולוגית בתחום והגידול בצורך לניצול מקורות נוספים של מי תהום, התפתחו שיטות הקדיחה והביאו להעמקה של הקידוחים המבוצעים עד לעומק של 1,500 מטר. בנוסף, משתמשת חברת מקורות בטכנולוגיות מים חדשניות כדי לתחזק ולשקם קידוחים אשר פוטנציאל הפקת המים שלהם יורד עם הזמן.