מערכת אספקת המים של מקורות מספקת כ - 1.5 מיליארד מ"ק מים לשנה, המהווים כ-70% מכלל אספקת המים במדינת ישראל. בשנת 2007 סופקו על ידי החברה כ- 1,100 מלמ"ק מים שפירים, כ - 120 מלמ"ק מים מליחים וכ - 230 מלמ"ק מי קולחים.

הזרמת המים למערכת מגיעה ממספר מקורות שונים: כ - 1,000 מלמ"ק הם מים המופקים מקידוחים (1,042 קידוחים) והיתרה מגיעים ממי הכנרת, אקוויפר ההר ואקוויפר החוף, מי ים מותפלים ומים מליחים מותפלים. אספקת המים מתבצעת באמצעות כ - 10,500 ק"מ של קווים, כ - 750 בריכות ו- 91 מאגרים.

מתקני מקורות מופעלים באמצעות מערכות בקרה ייחודיות, המשמשות הן לניהול שוטף והן לחיזוי של צרכים עתידיים. הודות למערכות משוכללות אלה, משודרים באמצעות רדיו או קווי תקשורת, נתונים תפעוליים למרכזי הבקרה, ואלו משדרים בתגובה (באמצעות תוכנות תפעול אוטומטיות) הנחיות הפעלה למתקני החברה.

מערכת אספקת המים של מקורות מאפשרת ניוד, ויסות כמויות מים וגמישות תפעולית. כך למשל, מאפשרת המערכת החדרת מים לאקוויפרים בשנים גשומות לצורך שימוש עתידי ושאיבה מוגברת בשנים שחונות. בנוסף מאפשרת המערכת שינוי כיוון זרימת המים - מדרום לצפון או מצפון לדרום - בהתאם לצרכים הנדרשים.