מחויבותה הראשית של מקורות הינה אספקת מים בזמינות ובאיכות גבוהות. החברה מתחייבת לספק לצרכן מים המכילים כמות כלור המבטיחה אי הימצאותם של חיידקים (עפ"י תקנות משרד הבריאות). כמו כן מקורות מחויבת לעמוד בסטנדרטים המחמירים של המשרד להגנת הסביבה ושל פיקוד העורף, בכל האמור בהגנת ובאיכות הסביבה ובייחוס בהיבט של חומרי החיטוי השונים שהינם חומרים מסוכנים.
ההכלרה מתבצעת בעשרות אתרים וביניהם המוביל הארצי, קידוחים, תחנות התפלה וטיפול במים ובכל נקודה, בה מכניסים מים לרשת ההובלה הארצית. רמת הכלור מנוטרת באופן רציף ע"י עובדי מקורות. מקורות משקיעה מאמצים רבים במיגון ובשיפור מתקני ההכלרה ובחיפוש טכנולוגיות מתקדמות המשרתות מטרה זו.